Komputerowe wspomaganie projektowania leków

O.F. Güner, ed. "Pharmacophore. Perception, Development, and Use in Drug Design", International University Line 2000.

N.C. Cohen "Molecular Modeling in Drug Design", Academic Press Inc. 1996.

A.R. Leach "Molecular Modeling. Principles and Applications", Longman 1996.

Wykład dostępny w:

1. 
   efektu farmakologicznego;
   

2. 
   struktury chemicznej;
   

3. 
   docelowego układu w organizmie;
   

4. 
   miejsca akcji leku;
   

Błona komórkowa

1. 
   lipidy; tworzenie tunelu w błonie (klaster z kilku cząsteczek leku - grzybobójcze) lub jako przenośnik jonów (walinomycyna).
   
2. 
   białka (glikoproteiny); enzymy i receptory komórkowe.
   
3. 
   kwasy nukleinowe.
   

aminokwasy:

syntezowane w ciele człowieka: niezbędne w pożywieniu:

Alaniana (Ala) Histydyna (His)

Arginina (Arg) Izoleucyna (Ile)

Asparagina (Asn) Leucyna (Leu)

Kwas asparaginowy (Asp) Lizyna (Lys)

Cysteina (Cys) Metionina (Met)

Kwas glutaminowy (Glu) Fenyloalanina (Phe)

Glutamina (Gln) Treonina (Thr)

Glicyna (Gly) Tryptofan (Trp)

Prolina (Pro) Valina (Val)

Seryna (Ser)

Tyrozyna (Tyr)

M
et-enkefalina - jeden z endogennych środków przeciwbólowych:

S

truktura drugorzędowa:

-helisa -kartka

S

Mioglobina
truktura trzeciorzędowa:

S
ynteza białka:

P
roces zwijania się białka:

1. 
   wiązania kowalencyjne; ^–S^–S^– (Cys ^... Cys)
   

2. 
   wiązania jonowe; ^–CO₂^{– ... +}H₃N^– (Asp ^... Lys)
   

3. 
   wiązania wodorowe; ^–O-H ^... O^– (Ser ^... Ser)
   

4. 
   wiązania van der Waalsa; Ph ^... Ph (Phe ^... Phe)
   

wiązania wodorowe i van der Waalsa są bardzo powszechne (także do oddziaływań z otaczającą wodą) i one decydują o str. III-rzędowej białka.

S
truktura czwartorzędowa: