Porównanie trwałości I budowy geometrycznej cis- I trans- n-metyloacetamidu



Pobieranie 34.32 Kb.
Data07.05.2016
Rozmiar34.32 Kb.
Modelowanie cząsteczkowe (1) Data

Porównanie trwałości i budowy geometrycznej cis- i trans- N-metyloacetamidu.


Ćwiczenie obejmuje narysowanie, optymalizację budowy geometrycznej oraz porównanie trwałości cis- i trans- N-metyloacetamidu przy użyciu metod półemiprycznych (PM3) i mechaniki molekularnej (pole siłowe MM+).






PM3 (kcal/mol)

MM+ (kcal/mol)

Wartości doświadczalne

cis










trans










cis-trans







2,07







cis

PM3


cis

MM+


wartości doświadczalne

trans

PM3


trans

MM+


wartości doświadczalne

dł. N-CH3






1,445







1,447

dł. N-CO






1,357







1,353

dł. C=O






1,200







1,200

kąt H-N-CH3






114,0







121,5

kąt H-N-CO






127,4







119,4

kąt H-N-C=O






0,0







180,0

Osoby:
Modelowanie cząsteczkowe (2) Data
Ćwiczenie polega na określeniu odległości pomiędzy dwoma azotami w (S)–nikotynie i porównanie z odległością pomiędzy tlenem karbonylowym i azotem w acetylocholinie w celu uzyskania odpowiedzi na pytanie: Czy (S)-nikotyna może zastąpić acetylocholinę w jej miejscu receptorowym?


Narysuj wzory strukturalne (S)-nikotyny i acetylocholiny. Wyznacz wartość ładunków cząsteczkowych w (S)-nikotynie i acetylocholinie przy wykorzystaniu metody półempirycznej AM1 i przenieś je do pola siłowego MM+. Dokonaj analizy konformacyjnej (S)-nikotyny i acetylocholiny w polu siłowym MM+.

(S)-nikotyna

Energia konformeru



Odległość

pomiędzy azotami



acetylocholina

Energia konformeru



Odległość

pomiędzy tlenem i azotem




























































































Osoby:




©absta.pl 2019
wyślij wiadomość

    Strona główna